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能源工業(yè)的微生物檢測分離和測量微生物有一個更好的方法。在冷卻塔中，追蹤細(xì)菌不僅僅是微生物的生長——你要追蹤風(fēng)險和測量效率。這些都是能源工業(yè)的基本任務(wù)，但它們本質(zhì)上也是無休止的。這是個機會。一種更快、更低成本地分離和測量微生物的方法，將使月復(fù)一月的回報成倍增長。你會節(jié)省時間，節(jié)省金錢，提高成績。無限期的?？焖傥⑸餀z測。RAN 生物技術(shù)公司的利工藝簡單，成本低廉，而且可以在數(shù)小時而不是數(shù)天內(nèi)得到可靠的數(shù)值結(jié)果。我們的兩步手持測試正在改變能源工業(yè)追蹤微生物的方式。你只需要花一點時間自己測試一下。此外，如果需要，可以擴大檢測范圍，以確定檢測到的微生物。

用于單細(xì)胞圖解研究的人腸組織的解離和 inDrops 微流體封裝 Alan J Simmons 1，Ken S Lau 2 Affiliations expandPMID: 35880121 PMCID: PMC9307676 DOI: 10.1016/j.xpro.2022.101570 Free PMC article leAbstractIn 基于液滴的單細(xì)胞 RNA 測序(scRNA-seq)實驗，將細(xì)胞連同其周圍的一些緩沖液和環(huán)境材料封裝成液滴用于 mRNA 捕獲和條形碼。該方案詳細(xì)說明了使用冷活性蛋白酶進行人體腸道組織解離的步驟，以及隨后分離單個上皮細(xì)胞，通過洗滌富集活力。接下來，描述了在 inDrops scRNA-seq 平臺上封裝的步驟。該方法已被證明適用于息肉、癌癥和發(fā)炎組織。關(guān)于該方案的使用和執(zhí)行的完整細(xì)節(jié)，請參閱 Chen 等人(2021)。關(guān)鍵詞: RNAseq; 單細(xì)胞。2022作者。利益沖突聲明作者聲明沒有相互競爭的利益。

環(huán)境研究用于環(huán)境研究的微生物分離和檢測知道水中有什么變得越來越容易。從海洋研究到生物醫(yī)學(xué)再到野生動物研究，環(huán)境研究人員必須盡可能多地了解他們所研究的世界，才能產(chǎn)生新的發(fā)現(xiàn)。微生物的分離和檢測是一個不可少的環(huán)節(jié)。但是傳統(tǒng)的培養(yǎng)皿方法需要幾天才能得到結(jié)果。 RMD 做得更快，更經(jīng)濟，并且具有同樣或更多的準(zhǔn)確性。快速微生物檢測的核心創(chuàng)新是一種智能親和色譜法納米材料，可以捕捉和分離樣本中的微生物。結(jié)果是可視的和數(shù)字化的，但測試可以用小型設(shè)備在現(xiàn)場進行。結(jié)果需要幾個小時，甚至幾分鐘。這種轉(zhuǎn)變正在改變研究的方式，你只需要花一點時間親自嘗試一下。

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全球流行的絕大多數(shù)病原體未被發(fā)現(xiàn)，影響了病人的護理，阻礙了疫情的準(zhǔn)備和反應(yīng)。為了能夠進行常規(guī)監(jiān)測和全面的診斷應(yīng)用，需要能夠擴大測試許多樣品的檢測技術(shù)1,2,3，同時測試許多病原體4,5,6。在這里，我們開發(fā)的組合陣列反應(yīng)多重評價核酸(CARMEN) ，一個可擴展的平臺，多重病原體檢測。在 CARMEN 平臺中，含有基于 CRISPR 的核酸檢測試劑7的納升液滴在微孔陣列中自組織8與擴增的樣品液滴配對，重復(fù)測試每個樣品針對每個 CRISPR RNA (crRNA)。CARMEN 和 Cas13檢測(CARMEN-Cas13)的組合能夠在單個陣列上對超過4,500個 crRNA 靶對進行強有力的檢測。使用 CARMEN-Cas13，我們開發(fā)了一種多重測定法，可以同時區(qū)分至少10個已發(fā)表基因組序列的所有169種人類相關(guān)病毒，并快速加入另外的 crRNA 以檢測2020年2019冠狀病毒疾病大流行的病原體。CARMEN-Cas13進一步實現(xiàn)了甲型流感病毒株的全面分型和幾十種 HIV 耐藥突變的多重鑒定。CARMEN 的內(nèi)在復(fù)用和吞吐能力使其具有可擴展性，因為小型化使每次測試的試劑成本降低了300多倍?？蓴U展的，高度復(fù)用的基于 CRISPR 的核酸檢測將診斷和監(jiān)測工作從高優(yōu)先級樣品的有針對性測試轉(zhuǎn)移到大樣本集的綜合測試，極大地有利于患者和公共衛(wèi)生9,10,11。

主要傳染病是對人類健康和全球安全的一些最大威脅，然而，對于絕大多數(shù)致病微生物，目前還沒有廣泛可用的分子檢測方法，這限制了它們的診斷和監(jiān)測。在許多能夠感染人類的病毒物種中(其中576個已經(jīng)測序，其中169個在2018年10月之前至少有10個已發(fā)表的基因組12) ，只有39個具有經(jīng) FDA (美國食品和藥物管理局)批準(zhǔn)的診斷。雖然已經(jīng)開發(fā)了實驗室開發(fā)的測試，用于在特定設(shè)施對不同的病原體進行臨床測試，但這些測試可能周轉(zhuǎn)時間很長，而且很少復(fù)用。常規(guī)的綜合診斷檢測將提供以前無法獲得的數(shù)據(jù)流，通知患者、醫(yī)護人員和政策制定者抑制和減輕疾病暴發(fā)。然而，由于缺乏可擴展和多路復(fù)用的技術(shù)來快速廉價地鑒定任何循環(huán)病原體，這些工具并不普遍可用(圖1a)。通過測序或微陣列雜交進行全面的疾病檢測提供了關(guān)于病原體基因型和進化的詳細(xì)信息，但由于樣品制備的成本和后勤需求，難以大規(guī)模實施4,5,6,13。快速，低成本的檢測方法，如基于 CRISPR 的方法，基于抗原的檢測，PCR 或環(huán)介導(dǎo)的等溫擴增(LAMP) ，在給定的反應(yīng)中僅檢測一種或少量的病原體1,2,3,7,14,15,16。結(jié)合這些方法的優(yōu)點，一個理想的診斷和監(jiān)測技術(shù)將是高度多元化和容易規(guī)模跨數(shù)百個樣本。

在人類和動物群體中鑒定多種循環(huán)病原體是一個大規(guī)模的檢測問題。CARMEN-Cas13工作流程示意圖。C，寨卡 cDNA 通過具有原子摩爾敏感性的單一 CARMEN-Cas13測定和數(shù)十個重復(fù)液滴對(黑點，重復(fù)數(shù)量為藍色)檢測; 紅線顯示中位數(shù)并用于構(gòu)建下面的熱圖。頂部，有代表性的水滴圖像。AU 任意單位。

微型化和自組織微流體技術(shù)使生物化學(xué)和細(xì)胞分析的大規(guī)模復(fù)用成為可能[17,18,19,20,21]。我們最近開發(fā)了一個微孔陣列系統(tǒng)，利用微型化和自我組織進行全面的組合實驗。在這個系統(tǒng)中，用戶準(zhǔn)備一組輸入作為液滴乳劑，輸入液滴在陣列的井中組織自己，創(chuàng)建所有可能的成對組合，而不需要額外的用戶努力或主動儀器8。我們設(shè)想基于 CRISPR 的核酸檢測可以與微孔陣列系統(tǒng)相結(jié)合，并行測試多個擴增樣品的多個分析物。

為了實現(xiàn)高度復(fù)用的核酸檢測，我們開發(fā)了 CARMEN (圖1b，擴展數(shù)據(jù)圖1)。CARMEN-Cas13的輸入是通過 PCR 或重組酶聚合酶擴增(RPA)和 Cas13檢測混合物擴增的樣品，其含有 Cas13，序列特異性 CRISPR RNA (crRNA)和切割報告基因7(擴展數(shù)據(jù)圖1)。每個放大樣品或檢測混合物在傳統(tǒng)的微量滴定板中制備，并與作為光學(xué)標(biāo)識符的特的基于溶液的熒光色碼結(jié)合。每種顏色編碼的溶液在含氟油中乳化，得到1-nl 的液滴。一旦乳化，來自所有樣品和檢測混合物的液滴匯集到一個單管中，并且ーー在一個移液步驟中ーー裝載到由聚二甲基硅氧烷(PDMS)模制的微孔陣列芯片中(圖1b，擴展數(shù)據(jù)圖1,2)。陣列中的每個微孔隨機容納來自池的兩個液滴，從而自發(fā)形成液滴化輸入的所有成對組合，并且陣列密封在玻璃基板上以物理隔離每個微孔。通過使用熒光顯微鏡鑒別液滴的顏色代碼來確定每個微孔的含量。暴露在電場中會合并每個微孔中的液滴對，并同時啟動所有的檢測反應(yīng)。熒光顯微鏡用于監(jiān)測每個檢測反應(yīng)(圖1b，擴展數(shù)據(jù)圖1,2)。

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